2024年8月19–22日 海口 承办单位：热带作物生物育种全国重点实验室、海南恒奕荣旅业服务有限公司
第二十一届全国植物基因组学大会
2022年8月19-22日 南宁 承办单位：广西大学、中国科学院遗传与发育生物学研究所
第二十届全国植物基因组学大会
2019年8月19-22日 南昌 承办单位：江西农业大学、中国科学院遗传与发育生物学研究所
第十九届全国植物基因组学大会
2018年8月19-22日 成都 承办单位：四川农业大学、中国科学院遗传与发育生物学研究所
第十八届全国植物基因组学大会
2017年8月19-22日 兰州 承办单位：兰州大学、中国科学院遗传与发育生物学研究所
第十七届全国植物基因组学大会
2016年8月19-22日 福州 承办单位：福建农林大学
第十六届全国植物基因组学大会
2015年8月19-22日 杨凌 承办单位：西北农林科技大学
第十五届全国植物基因组学大会
2014年8月19-22日 合肥 承办单位：安徽农业大学
第十四届全国植物基因组学大会
2013年8月20-22日 南京 承办单位：南京农业大学
第十三届全国植物基因组学大会
2012年8月19-22日 泰安 承办单位：山东农业大学
第十二届全国植物基因组学大会
2011年8月18-21日 安阳 承办单位：中国农业科学院棉花研究所
第十一届全国植物基因组学大会
2010年8月19-21日 长春 承办单位：吉林省农业科学院
第十届全国植物基因组学大会
2009年8月19-21日 重庆 承办单位：西南大学
第九届全国植物基因组学大会
2008年8月18-20日 广州 承办单位：华南农业大学
第八届全国植物基因组学大会
2007年8月18-20日 上海 承办单位：中国科学院国家基因研究中心
第七届全国植物基因组学大会
2006年8月8-10日 哈尔滨 承办单位：黑龙江大学
第六届全国植物基因组学大会
2005年8月17-21日 昆明 承办单位：云南省农业科学院、云南大学
第五届全国植物基因组学大会
2004年8月19-22日 武汉 承办单位：华中农业大学
第四届全国植物基因组学大会
2003年9月22-26日 西安 承办单位：西北农林科技大学、西北大学、杨凌国家农业高新技术产业示范区管委会、秦丰农业科技股份公司
第三届全国植物基因组学大会
2002年8月19-22日 北京 承办单位：中国农业科学院
第二届全国植物基因组学大会
2001年8月22-26日 杭州 承办单位：浙江农业大学（现浙江大学）
第一届全国植物基因组学大会
2000年8月24-27日 大连 承办单位：辽宁师范大学